琼脂糖凝胶回收DNA片段的核心原则
选择性分离:通过电泳分离目标DNA条带后,需精确切取含目的片段的凝胶区域,避免污染或损失。
高效吸附与洗脱:利用硅基质膜或离心柱特异性结合DNA,通过缓冲液梯度洗脱实现纯化。
最小化损伤:紫外照射时间需严格控制(<30秒),推荐使用蓝光切胶仪减少DNA断裂风险。
关键操作步骤与注意事项
1. 电泳与切胶
凝胶浓度选择:
大片段(>1kb)用0.5%-1%琼脂糖,小片段(<500bp)用1.5%-2%。
切胶要点:
快速切割目标条带,胶块体积≤0.3g,避免紫外过度暴露。
刀片需灭菌,防止外源DNA污染。
2. 溶胶与吸附
溶胶条件:
55-65℃水浴溶解,每3分钟震荡混匀,确保琼脂糖融化(溶液呈淡黄色)。
胶块过大时需分次处理或增加溶胶液体积。
离心柱操作:
溶胶液转移时避免触碰滤膜,离心后检查收集管液体颜色(黄色提示溶胶过量)。
3. 洗脱与纯化
洗脱优化:
洗脱液预热至65℃,体积30-50μl,垂直滴加至膜中央。
洗脱前空离2分钟去除残留乙醇,避免抑制后续酶反应。
质量验证:
通过A260/A280(1.8-2.0)和A260/A230(>1.8)评估纯度。
常见问题与解决方案
回收率低:
可能原因:胶块未溶解、缓冲液pH异常、洗脱液未预热。
解决:延长溶胶时间、调整pH至8.0-8.5、增加洗脱液静置时间。
产物污染:
可能原因:胶块残留多糖、乙醇未挥发干净。
解决:二次纯化或使用糖原辅助小片段回收。
安全与设备维护
防护措施:
操作EB染料时需戴手套,废弃物单独存放于橙色容器。
设备清洁:
电泳槽每月用0.1M HCl浸泡,紫外灯管每200小时更换。
注:以上仅供参考,科研使用,不作为实际数据,实验需严格遵循说明或咨询技术老师。
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