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如何判断RNA样本是否降解?

更新时间:2025-12-29  |  点击率:44

  标签:天津天正信达 RNA逆转录试剂盒 逆转录试剂盒 PCR试剂盒 小鼠白介素ELISA试剂盒

  

  判断RNA样本是否降解,最直接有效的方法就是‌琼脂糖凝胶电泳‌,它能直观显示RNA的完整性。天正信达小编来给你拆解一下具体怎么看:

  一、电泳结果判断标准

  条带清晰度‌:

  优质RNA‌:28S和18S rRNA条带清晰、锐利,28S亮度约为18S的2倍。

  降解RNA‌:条带模糊、弥散,或出现低分子量拖尾。

  条带比例‌:

  28S/18S亮度比正常为1.5–2:1,若比例明显降低(如接近1:1),提示RNA降解。

  加样孔污染‌:

  加样孔出现荧光区带,可能提示DNA污染或RNA降解。

  二、其他辅助方法

  分光光度法‌:

  测A260/A280(1.8–2.0)和A260/A230(>2.0),比值异常可能提示污染或降解。

  生物分析仪‌:

  通过RIN值(RNA完整性数)评估,RIN>7为高质量,<5提示降解。

  三、常见降解原因

  RNase污染‌:操作环境或耗材未严格去RNase。

  保存不当‌:未-80℃保存或反复冻融。

  机械剪切‌:剧烈震荡或移液操作粗暴。

  四、操作建议

  电泳条件‌:1.2%琼脂糖凝胶,75–100V电泳至染料泳动2–3cm。

  染色‌:用溴化乙锭(0.5 μg/mL)或SYBR绿Ⅱ染色10–30分钟。

  防护‌:操作时戴手套,避免紫外线直接照射。

  五、注意事项

  防降解‌:全程冰上操作,使用RNase-free耗材。

  gDNA污染‌:选择带gDNA去除功能的试剂盒。

  引物选择‌:Oligo dT适合完整mRNA,随机引物适用性更广。

  注:以上仅供参考,本试剂仅供科研使用,不作为实际数据,实验需严格遵循说明或咨询技术老师。

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